Omix

代謝経路 モデリング 可視化 ツール

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メーカー

Omix Visualization GmbH&Co.KG.

ソフトウェア

Omixの製品概要

広範囲のデータ可視化機能を備えた、ユーザーフレンドリーでカスタマイズ性の高い、代謝ネットワーク図のエディタ・モデリングツール。

主にトランスクリプトミクス、メタボロミクス、フラクソミクス分野において、ネットワーク図の直接的なコンテキストでの、マルチオミックス・データのインタラクティブなマッピングに用いられます。

Omixを使用したデータ可視化の例をこちらでご覧いただけます → Visualization Examples

主な用途
  • 医療3D可視化
  • 解剖学教育
  • 手術計画支援
  • 工学CADレビュー
  • VR/AR連携

本製品の提供は研究用途のみに限定されます

Omixの製品仕様

ライセンスについて

Omix
  • ベースパッケージに必要プラグインを組み合わせて購入
  • 見積時には希望プラグインをご指定ください
FluxOmix Modeling Suite
  • Omixベースパッケージに10種類のプラグインが標準付属
  • 追加プラグイン購入も可能
標準付属プラグイン(FluxOmix Modeling Suite)
  • 13CFLUX2 Launcher Plug-In
  • HDF5 Plug-In
  • Chemical Structure Plug-In
  • CumoVis Plug-In(※Mac OS X 非対応)
  • SSH Access Plug-In
  • Network Constraints Plug-In
  • 13CFLUX2 FWDSIM Import Plug-In
  • Atomic Layer Modeling Plug-In
  • Free Flux Plug-In
  • 13CFLUX2 FluxML / Modeling Plug-In

※必要に応じて追加プラグイン購入が可能です。

プラグイン対応OS(概要)
  • Windows
    • すべてのプラグインが利用可能(推奨環境)
  • Mac OS X
    • 一部プラグインは非対応
    • 非対応例:
      • CumoVis Plug-In
      • 13CFLUX2 関連プラグイン
  • Linux
    • 多くのプラグインが対応
    • 13CFLUX2 関連プラグインも利用可能
  • Atomic Layer Modeling Plug-In
    • Windows / Mac OS X / Linux 全対応
  • SSH Access Plug-In
    • Windows / Mac OS X / Linux 全対応
エディションの種類
  • Educational Edition:学生限定ライセンス(助成研究・学術出版不可)
  • Academic Edition:非商用研究・公的教育機関向け
  • Enterprise Edition:商用利用可

各エディションの機能比較表はこちら

注意事項
  • 各ライセンスはシングルユーザーライセンスです。
  • Omixは12ヵ月の年間ライセンスです。
  • FluxOmix Modeling SuiteにはEducational Editionはございません(Omix のみ)。
  • Mac OS X では CumoVis および 13CFLUX2 関連プラグインが利用不可です。
  • 購入時には必ず使用予定OSをご確認ください。
  • 全プラグインを利用する場合は Windows 環境が推奨されます。

メーカーサイトURL

https://www.omix-visualization.com/

主な機能
  • 高品質なネットワーク図の作成と多彩な注釈機能
  • 実験データ・シミュレーションデータの代謝ネットワーク上でのインタラクティブ可視化
  • ネットワーク構造を多階層表示し、複雑さを低減しつつ重点部分を柔軟に強調
  • 半自動描画機能による作図支援
  • プラグインによる機能拡張対応
  • 時系列データのアニメーション表示
  • 化学構造式の可視化
  • 動力学(キネティック)モデリング機能
  • 代謝ネットワークの原子レイヤーモデリングと可視化
  • 13C同位体標識実験のモデリング(13CFLUX2への入力生成)
  • オミクスデータおよびネットワークトポロジーの3D可視化
  • ストイキオメトリック解析(基本フラックスモード、ネットワーク依存性、フラックスバランス解析など)

Omixの機能紹介ページはこちら (動画や画像をご覧いただけます)

Omix のプラグインについて

Omix には各種プラグインが用意されており、さまざまなアプリケーションとの連携や機能拡張が可能です。

プラグインについての情報は こちらのページ をご覧ください。

Omix | 代謝経路 モデリング 可視化 ツール

※各ブラグインに関するドキュメンテーションはこちらのページをご覧ください

動画


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本製品の提供は研究用途のみに限定されます

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