CodonCode Aligner
DNA配列アセンブリ変異解析アノテーションソフト

メーカー

CodonCode Corporation

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カテゴリー

シミュレーション・解析データ管理・分析生命・環境学医療学情報学

タグ

遺伝子解析バイオインフォマティクスゲノム解析

CodonCode Alignerの製品概要

初心者から研究者まで安心して使える、DNA配列解析オールインワンツール。

CodonCode Alignerは、サンガーシーケンスおよび次世代シーケンス(NGS)データに対応した高機能DNA配列解析ソフトウェアです。アセンブリ、コンセンサス配列作成、SNP・InDel検出、配列アノテーション、複数配列の比較解析など、DNA配列解析に不可欠な機能が集約されています。
Phred-Phrapとの互換性を備え、シーケンスクオリティスコアにも完全対応。正確で信頼性の高い解析を実現します。研究のニーズに応じた柔軟な解析が可能です。

初めての方でも安心して使える操作性と、論文作成にそのまま活用できる高精度な解析結果が高評価です。直感的なインターフェースと豊富な機能により、分子生物学、遺伝学、ゲノム研究、医学研究、教育など、幅広い分野で利用されています。

※CodonCode Alignerは、WWindows と macOS に対応しています

主な用途

ゲノム解析 (ヒト・動植物・微生物)
SNP・InDelの探索と解析
臨床検査・診断研究 (変異解析)
大学院・研究室における教育用ツール
論文用配列図やレポート作成

メーカーサイトURL

https://www.codoncode.com/

CodonCode Aligner 機能について

Import sequences from text files
Import sequences from ABI, SCF, and FASTQ files
End clip
Vector trim
Assemble contigs
Align to a reference sequence
Align contigs to each other while keeping the links to the traces
Assemble or align in groups, based on sample names
Find heterozygous mutations
Analyze heterozygous insertions and deletions
Define regions of interest (“features”), for example low quality consensus regions
Quickly navigate between user-defined features
Generate phylogenetic trees and restriction maps
Run Phred and Phrap directly from Aligner projects
Export sequences and features
See difference tables and protein translations
Design primers
Assemble bacterial genomes and small NGS sequencing projects
Find enzymes for RFLP analysis & create virtual gel
Analyze methylated sequences & view raw trace data

機能に関する詳細はこちらをご覧ください

検索キーワード:
CodonCode / CodonCode Aligner / DNA配列解析 / 配列アセンブリ / シーケンス解析 / SNP解析 / 変異解析 / 次世代シーケンス / NGS解析 / InDel解析 / コンセンサス配列 / 遺伝子解析 / 生物学 / ゲノム解析 / 塩基配列 / サンガーシーケンス / マルチサンプル解析 / 解析ソフト / バイオインフォマティクス / 配列アノテーション

チュートリアルビデオ (メーカーWEBサイト)

ライセンス形態

ユーザーさまのご所属により、適用されるライセンスが異なります。

Academic / Government
大学や非営利団体(政府出資による研究機関を含む)に所属するユーザー向けライセンス。
Phred および Phrap のワークステーションバージョンを無償で使用できるライセンスが含まれます。
Business
営利を目的とする企業に所属するユーザー向けライセンス (商用ライセンス)。
BusinessライセンスにはPhred および Phrapのライセンスや
Phred-Phrapパッケージのコンポーネントは含まれません。

上記ライセンスそれぞれに、以下の形態がございます。
ご希望のライセンス形態をお知らせください。

Single User Licenses
特定の1台のコンピュータに紐づけられるライセンス
Concurrent Licenses (License Server/Network licenses)
Aligner License Serverでライセンスを管理することで、購入ライセンス数分までであれば
同時に不特定の複数台のコンピュータで CodonCode Alignerの利用が可能なライセンス。

※Aligner License Serverのダウンロード方法や設定方法を含む詳細はこちらのページをご確認ください

各ライセンスは永久ライセンスで、1年間有効の無償アップデートとサポートが含まれています
学生(学部生、大学院生)と博士研究員(postdoc)向けのStudent licenseもございます(2年間有効)。
ご希望の際はお問い合わせください

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商品名	納品方法	納期	価格
CodonCode Aligner - Academic / Government : Single User Licenses	電子デリバリー	お問い合わせください	お問い合わせください
CodonCode Aligner - Academic / Government : Concurrent Licenses	電子デリバリー	お問い合わせください	お問い合わせください
CodonCode Aligner - Business : Single User Licenses	電子デリバリー	お問い合わせください	お問い合わせください
CodonCode Aligner - Business : Concurrent Licenses	電子デリバリー	お問い合わせください	お問い合わせください