ChemCraft

分子の3D可視化とモデリングを簡便かつ高精度に実現できる分子可視化ソフトウェア

主なパッケージのサポート

• GAMESS(US)、Firefly (PC GAMESS)
• Gaussian94–09

主な機能

• 原子座標による分子の3次元画像のレンダリング
  – the possibility to examine or modify any geometrical parameter in the molecule (distance, angle)
• 量子化学計算ソフトウェアの出力ファイルの視覚化
  (Gamess, Gaussian, NWChem, ADF, Molpro, Dalton, Jaguar, Orca, QChem)
  • representation of individual geometries from files (optimized structure, geometry at each optimization step, etc.)
  • animation of vibrational modes, graphical representation of gradient (forces on nuclei)
  • visualization of molecular orbitals in form of isosurfaces or colored planes
  • visualization of vibrational or electronic (e.g., TDDFT) spectra
  • possibility to show SCF convergence graphs, and some other features
• 分子の構築、分子構造変更のためのツール
  • using standard molecular fragments, “dragging” atoms or fragments in the molecule’s image
  • utility for setting a symmetry point group, and other possibilities
• 出版可能な画像の作成
  – Producing publication-ready images of molecules in customizable display modes,
  containing required designations (labels, lines, etc.)
• 入力ファイル用の追加ユーティリティ
  • construction of Z-matrices
  • automatic generation of input files with non-standard basis sets
  • converting MOs read from an output file into the format of input file

Chemcraftのグラフィカルエンジンは、ハードウェアアクセラレーションを必要としません

機能の例

Chemcraft のインターフェース

量子化学計算ソフトウェアの出力ファイルから抽出される利用可能なすべてのデータ（原子座標、エネルギー勾配など）の階層リストと視覚化

エネルギー勾配の視覚化の例

計算データの信頼性の高い視覚化

分子軌道の可視化の例

• GAMESS(US)出力ファイルから基底関数系情報、分子軌道係数を抽出
• 分子軌道をレンダリング

取り扱い可能なファイル形式

Chemcraft for Gaussian users:
We recommend to type #P GFINPUT POP(FULL, NBO) in Gaussian input files for visualization of Gaussian outputs via Chemcraft.

Chemcraft for ADF users:
Chemcraft reads ADF output files, ASCII TAPE21 files and ASCII TAPE41 files.

Working with other formats:

GAMESS(US), Gaussian, ADF, NWChem, Jaguar, Orca, Dalton, GAMESS(UK),
Turbomole, Molpro and QChem output files, HyperChem files
files of MSI or PDB formats (* これらのファイル形式はサポートされているわけではありません)
MolDraw and Priroda programs format, Niobate (NBO’s 31-40 files),
Molden, MFJ, SDF and Tinker files,
Crystal、VASP and Shellx files, CIF (Crystallographic Information File) files,
カルテシアン座標系（直交座標系、Cartesian Coordinate）を記録したテキストファイル、
原子の座標をインポート/エクスポートするためのインターフェイス（テキスト形式）

※詳細につきましては こちら をご参照ください

動画

関連研究キーワード

「原子座標に基づく分子の3Dレンダリング」とは、分子構造の詳細な可視化を可能にする技術のことです。原子の位置情報をもとに、分子の形状や結合状態を高精度で表現します。化学反応のメカニズムや分子間相互作用の理解に役立ち、科学研究や教育において重要な役割を果たします。

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