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Omix

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代謝経路のモデリングと可視化のためのツール
広範囲のデータ可視化機能を備えた、ユーザーフレンドリーでカスタマイズ性の高い、代謝ネットワーク図のエディタ・モデリングツール。

主にトランスクリプトミクス、メタボロミクス、フラクソミクス分野において、ネットワーク図の直接的なコンテキストでの、マルチオミックス・データのインタラクティブなマッピングに用いられます。

Omixを使用したデータ可視化の例をこちらでご覧いただけます → Visualization Examples

検索キーワード :
FluxOmix Modeling Suite / 13CFLUX2 / Transcriptomics / トランスクリプトーム / Metabolomics / メタボローム解析 / Fluxomics / Multi-Omics

メーカー
Omix Visualization GmbH&Co.KG.
https://www.omix-visualization.com/

取り扱い商品の一例

商品名 納品方法 納期 価格
Omix 電子デリバリー 4-5日 お問合せください
FluxOmix Modeling Suite 電子デリバリー 4-5日 お問合せください
Omix 用 Plug-In (ご希望のプラグインがあればお知らせください) 電子デリバリー 4-5日 お問合せください

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商品説明


【機能の一例】

・Drawing high-quality network diagrams with extensive annotation potential.
・Interactive visualization of data from experiment as well as simulation in metabolic networks.
・Different levels of detail to decrease complexity and flexibly highlight different aspects of the network structure.
・Support of the drawing process by semi-automatic drawing features.
・Extensible by plug-ins.
・Visual analysis of time-dependent data by animations.
・Visualization of chemical structures.
・Kinetic modeling.
・Modeling and visualization of a metabolic network's atomic layer.
・Modeling of 13C isotope labeling experiments as input for 13CFLUX2.
・3D visualization of omics-data and network topologies.
・Stoichiometric analysis: elementary flux modes, network dependencies, flux balances...

Omixの機能紹介ページはこちら (動画や画像をご覧いただけます)



【Omix のプラグインについて】



Omixには各種プラグインが用意されており、 さまざまなアプリケーションとの連携や機能拡張が可能です。
プラグインについての情報はこちらのページをご覧ください

プラグインの例
データベースアクセス、データインプット、ファイルアクセス、モデルフォーマット、モデリング、
ネットワーク分析、可視化、ビジュアルアウトプット、13CFLUX2 プラグイン

各ブラグインに関するドキュメンテーションはこちらのページをご覧ください



【ライセンスの種類】

・Omix
基本のベースパッケージ。ご希望のプラグインを組み合わせてご購入いただけます。
あわせてお見積りいたしますので、お問合せの際にはご希望のプラグインをお知らせください。

・FluxOmix Modeling Suite
ベースパッケージに 以下の10種類のプラグインが付属しています。
必要なプラグインを追加でご購入もいただけますので、ご希望がございましたらお知らせください。

- 13CFLUX2 Launcher Plug-In
- HDF5 Plug-In
- Chemical Structure Plug-In
- CumoVis (not available on : Mac OS X)
- SSH Access Plug-In
- Network Constraints Plug-In
- 13CFLUX2 FWDSIM Import Plug-In
- Atomic Layer Modeling Plug-in
- Free Flux Plug-In
- 13CFLUX2 FluxML Plug-In
- 13CFLUX2 Modeling Plug-In


【エディションの種類】

Educational Edition
- 学生限定ライセンス
(no use within funded research and not for scientific publications)

Academic Edition
- 非商用用途限定ライセンス
(for non-profit research and educational institutions of the public sector)

Enterprise Edition
- 商用ライセンス

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各エディションの機能比較表はこちら

・各ライセンスはシングルユーザーライセンスです
・Omixは12ヵ月の年間ライセンスです
・FluxOmix Modeling Suite には Educational Edition はございません (Omix のみ)

動画

レビュー

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